Para registrar um movimento financeiro no agendamento, você deve seguir o passo a passo de um agendamento e selecionar a opção "Lançar atendimento no financeiro". Veja abaixo como preencher os campos:

Selecione a opção "Lançar atendimento no financeiro" e preencha os campos.
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Você deve utilizar o item "Pago" para marcar a data em que o cliente PAGOU o atendimento, ou seja, marque apenas se o atendimento estiver de fato pago pelo paciente.
O item "Pago" não precisa ser marcado no momento do agendamento. Você pode utilizar o botão "Receber"  para marcar o movimento como pago no momento do atendimento ou quando desejar, através do histórico do paciente ou acessando os movimentos financeiros. Saiba como receber um pagamento após o atendimento.

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Ao fazer um agendamento marcando a função "Repetir" e "Lançar atendimento no financeiro", o sistema irá lançar o valor integral para cada agendamento.
Exemplo: Agendamento com 10 repetições e valor de R$ 50,00: serão 10 lançamentos da receita de R$50,00 nos movimentos financeiros. Da mesma forma para a comissão, caso houver um procedimento selecionado. 

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Se você desmarcar a opção "Lançar atendimento no financeiro" não serão lançados os valores de RECEITA deste atendimento.
Dessa maneira, caso houver um procedimento selecionado, será lançado somente o valor da despesa do procedimento, ou seja, da comissão do profissional nos movimentos financeiros. A receita do procedimento não é lançada sem que este campo seja selecionado.

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Quando o campo "Lançar atendimento no financeiro" não é exibido no momento do agendamento é porque há um procedimento selecionado com estas configurações específicas.
No momento do cadastro desse procedimento, no campo "Alterar valor", (em que é selecionado se o profissional terá permissão ou não para ver  e editar o valor do procedimento) foi selecionada a opção "Não". Quando essa opção é selecionada no cadastro do procedimento, o campo "Lançar atendimento no financeiro" do agendamento/atendimento não é exibido mas, tanto a receita como a despesa do procedimento são lançadas automaticamente nos movimentos financeiros. Saiba como cadastrar procedimentos.